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中级

This class is geared towards biologists, bacteriologists, and bioinformaticians with a basic knowledge of comparative genomics.

完成时间大约为14 小时
英语(English)
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This class is geared towards biologists, bacteriologists, and bioinformaticians with a basic knowledge of comparative genomics.

完成时间大约为14 小时
英语(English)

提供方

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弗吉尼亚大学

教学大纲 - 您将从这门课程中学到什么

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完成时间为 1 小时

Introduction

完成时间为 1 小时
7 个视频 (总计 42 分钟)
7 个视频
History of PATRIC and the BRC program3分钟
PATRIC overview - tabs and information16分钟
Registering and logging on to PATRIC2分钟
PATRIC workspace-Create Shared Workspace6分钟
Sharing a genome with other PATRIC users4分钟
Copying a genome annotation job to a shared workspace3分钟
1 个练习
PATRIC overview, login, and workspace sharing30分钟
2

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完成时间为 1 小时

Assembly

完成时间为 1 小时
7 个视频 (总计 49 分钟)
7 个视频
Uploading read files to the workspace for assembly11分钟
Submitting reads to the Genome Assembly Service8分钟
Selecting assembly strategies and submitting the assembly job8分钟
Monitoring the assembly job and reviewing job results7分钟
Genome coverage in Genome Report2分钟
Assembly questions and getting help with problems4分钟
1 个练习
Review of genome assembly30分钟
3

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完成时间为 2 小时

Annotation

完成时间为 2 小时
7 个视频 (总计 77 分钟)
7 个视频
Uploading contig files to the PATRIC workspace12分钟
Submitting a job to the PATRIC Genome Annotation Service7分钟
Reviewing the resulting Genome Report19分钟
Downloading the generated files 11分钟
Viewing your annotated genome in PATRIC15分钟
Finding help or reporting problems with the service5分钟
1 个练习
Review of genome annotation30分钟
4

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完成时间为 2 小时

Comprehensive Genome Analysis

完成时间为 2 小时
10 个视频 (总计 101 分钟)
10 个视频
Submitting a job using reads16分钟
Submitting contigs8分钟
Full Genome Report13分钟
Job Results11分钟
Assembly results11分钟
Annotation results12分钟
Viewing annotated genome12分钟
Finding help and citing5分钟
Hybrid Assembly Summary8分钟
1 个练习
Review of the Comprehensive Genome Analysis Service30分钟

常见问题

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