تحليل المجموعات الهرمية باستخدام المسافات الإقليدية

提供方
Coursera Project Network
在此指导项目中,您将:

فهم أهمية واستخدام المجموعات الهرمية باستخدام ملفات تخصيص الانحراف.

تحدد موقع ملفات الجينوم الفيروسي (cDNA) ومعالجتها لحساب ملفات تعريف الانحراف.

فهم نظرية استخدام معادلة فيثاغورس لحساب المسافة الإقليدية. وتطبيق ذلك باستخدام بايثون لبناء مصفوفة ربط.

Clockساعاتين
Intermediate中级
Cloud无需下载
Video分屏视频
Comment Dots阿拉伯语(Arabic)
Laptop仅限桌面

بنهاية هذا المشروع ، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً أو دندوجرام بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد الدندوجرام الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيبة النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. ملاحظة: تعمل هذه الدورة التدريبية بشكل أفضل للمتعلمين المقيمين في منطقة أمريكا الشمالية. نعمل حاليًا على توفير نفس التجربة في مناطق أخرى.

您要培养的技能

  • Python Programming
  • Genomics
  • plotting

分步进行学习

在与您的工作区一起在分屏中播放的视频中,您的授课教师将指导您完成每个步骤:

  1. الخطوة الأولى: مقدمة (توسيع تحليل الانحراف)

  2. الخطوة الثانية: تحديد موقع ملفات البيانات ومعالجتها

  3. الخطوة الثالثة: استيعاب البيانات. فهم مجموعة البيانات الناتجة والتعامل معها

  4. الخطوة الرابعة: التجميع الهرمي - (المقياس - Metric)

  5. الخطوة الخامسة: التجميع الهرمي - (الترتيب والطرق Ordering & Methods)

  6. الخطوة الساسدسة: رسم المخطط الشجري (dendrogram)

  7. الخطوة السابعة: تحليل المخطط الشجري (dendrogram)

  8. الخطوة الثامنة: أخطاء يجب تجنبها

指导项目工作原理

您的工作空间就是浏览器中的云桌面,无需下载

在分屏视频中,您的授课教师会为您提供分步指导

常见问题

常见问题

还有其他问题吗?请访问 学生帮助中心