课程信息
4.2
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28 个审阅
100% 在线

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立即开始,按照自己的计划学习。
可灵活调整截止日期

可灵活调整截止日期

根据您的日程表重置截止日期。
高级

高级

完成时间(小时)

完成时间大约为22 小时

建议:6 weeks of study, 3-5 hours per week...
可选语言

英语(English)

字幕:英语(English)

您将获得的技能

BioinformaticsData Clustering AlgorithmsBig DataR Programming
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教学大纲 - 您将从这门课程中学到什么

1
完成时间(小时)
完成时间为 2 小时

Genes and Data

After this module, you will be able to 1. Locate and download files for data analysis involving genes and medicine. 2. Open files and preprocess data using R language. 3. Write R scripts to replace missing values, normalize data, discretize data, and sample data. ...
Reading
11 个视频 (总计 59 分钟), 2 个阅读材料, 6 个测验
Video11 个视频
Introduction to Module1分钟
DNA and Genes9分钟
RNA and Proteins6分钟
Transcription Process4分钟
Transcription Animation1分钟
Translation Process5分钟
Translation Animation2分钟
Data, Variables, and Big Datasets6分钟
Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis9分钟
Working with cBioPortal - Gene Networks9分钟
Reading2 个阅读材料
Module 1 cBioPortal Data Analytics10分钟
Module 1 Resources10分钟
Quiz6 个练习
DNA, RNA, Genes, and Proteins4分钟
Transcription and Translation Processes6分钟
Data, Variables, and Big Datasets4分钟
Working with cBioPortal6分钟
Module 1 Quiz20分钟
Module 1 cBioPortal Data Analytics8分钟
2
完成时间(小时)
完成时间为 5 小时

Preparing Datasets for Analysis

After this module, you will be able to: 1. Locate and download files for data analysis involving genes and medicine. 2. Open files and preprocess data using R language. 3. Write R scripts to replace missing values, normalize data, discretize data, and sample data. ...
Reading
13 个视频 (总计 75 分钟), 4 个阅读材料, 8 个测验
Video13 个视频
Datasets and Files10分钟
Data Sources11分钟
Importance of Data Preprocessing4分钟
Data Preprocessing Tasks2分钟
Replacing Missing Values3分钟
Data Normalization9分钟
Data Discretization5分钟
Feature Selection3分钟
Data Sampling2分钟
Principles of R6分钟
R Language1分钟
Jupyter Notebooks 1017分钟
Reading4 个阅读材料
Jupyter Notebooks Essentials10分钟
Notebook Module 2 Tutorial10分钟
Module 2 R Data Preprocessing10分钟
Module 2 Resources10分钟
Quiz8 个练习
Datasets and Files4分钟
Data Preprocessing Tasks4分钟
Replacing Missing Values2分钟
Normalization and Discretization4分钟
Data Reduction4分钟
Working with R4分钟
Module 2 Quiz20分钟
Module 2 R Data Preprocessing10分钟
3
完成时间(小时)
完成时间为 4 小时

Finding Differentially Expressed Genes

After this module, you will be able to 1. Select features from highly dimensional datasets. 2. Evaluate the performance of feature selection methods. 3. Write R scripts to select features from datasets involving gene expressions. ...
Reading
9 个视频 (总计 53 分钟), 4 个阅读材料, 6 个测验
Video9 个视频
Overview of Feature Selection Methods13分钟
Filter Methods4分钟
Wrapper Methods4分钟
Evaluation Schemes7分钟
Selecting Differentially Expressed Genes3分钟
Heatmaps6分钟
R Scripts for Feature Selection3分钟
Jupyter Notebooks 1017分钟
Reading4 个阅读材料
Notebook Module 3 Tutorial10分钟
Jupyter Notebooks Essentials10分钟
Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10分钟
Module 3 Resources10分钟
Quiz6 个练习
Feature Selection Methods4分钟
Evaluation Schemes2分钟
Differentially Expressed Genes4分钟
Heatmaps4分钟
Module 3 Quiz16分钟
Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10分钟
4
完成时间(小时)
完成时间为 4 小时

Predicting Diseases from Genes

After this module, you will be able to 1. Build classification and prediction models. 2. Evaluate the performance of classification and prediction methods. 3. Write R scripts to classify and predict diseases from gene expressions....
Reading
12 个视频 (总计 85 分钟), 4 个阅读材料, 10 个测验
Video12 个视频
Overview of Classification and Prediction Methods8分钟
Classification Methods Based on Analogy12分钟
Classification Methods Based on Rules13分钟
Classification Methods Based on Neural Networks7分钟
Classification Methods Based on Statistics3分钟
Classification Methods Based on Probabilities7分钟
Prediction Methods4分钟
Evaluation Schemes13分钟
Prediction Workflow4分钟
R Scripts for Prediction1分钟
Jupyter Notebooks 1017分钟
Reading4 个阅读材料
Jupyter Notebooks Essentials10分钟
Notebook Module 4 Tutorial10分钟
Module 4 R Predicting Diseases from Genes10分钟
Module 4 Resources10分钟
Quiz10 个练习
Overview4分钟
Classification with Analogy2分钟
Classification based on Rules2分钟
Classification with Neural Networks2分钟
Classification based on Statistics2分钟
Classification based on Probabilities2分钟
Prediction Models2分钟
Evaluation Schemes2分钟
Module 4 Quiz20分钟
Module 4 R Predicting Diseases from Genes10分钟

讲师

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Isabelle Bichindaritz

Associate Professor
Computer Science

关于 The State University of New York

The State University of New York, with 64 unique institutions, is the largest comprehensive system of higher education in the United States. Educating nearly 468,000 students in more than 7,500 degree and certificate programs both on campus and online, SUNY has nearly 3 million alumni around the globe....

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