课程信息

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This course distills for you expert knowledge and skills mastered by professionals in Health Big Data Science and Bioinformatics. You will learn exciting facts about the human body biology and chemistry, genetics, and medicine that will be intertwined with the science of Big Data and skills to harness the avalanche of data openly available at your fingertips and which we are just starting to make sense of. We’ll investigate the different steps required to master Big Data analytics on real datasets, including Next Generation Sequencing data, in a healthcare and biological context, from preparing data for analysis to completing the analysis, interpreting the results, visualizing them, and sharing the results.
Needless to say, when you master these high-demand skills, you will be well positioned to apply for or move to positions in biomedical data analytics and bioinformatics. No matter what your skill levels are in biomedical or technical areas, you will gain highly valuable new or sharpened skills that will make you stand-out as a professional and want to dive even deeper in biomedical Big Data. It is my hope that this course will spark your interest in the vast possibilities offered by publicly available Big Data to better understand, prevent, and treat diseases.

学生职业成果

50%

完成这些课程后已开始新的职业生涯

43%

通过此课程获得实实在在的工作福利

20%

加薪或升职

可分享的证书

完成后获得证书

100% 在线

立即开始，按照自己的计划学习。

可灵活调整截止日期

根据您的日程表重置截止日期。

高级

完成时间大约为40 小时

英语（English）

字幕：英语（English）, 西班牙语（Spanish）, 俄语（Russian）, 法语（French）

您将获得的技能

BioinformaticsData Clustering AlgorithmsBig DataR Programming

学生职业成果

50%

完成这些课程后已开始新的职业生涯

43%

通过此课程获得实实在在的工作福利

20%

加薪或升职

可分享的证书

完成后获得证书

100% 在线

立即开始，按照自己的计划学习。

可灵活调整截止日期

根据您的日程表重置截止日期。

高级

完成时间大约为40 小时

英语（English）

字幕：英语（English）, 西班牙语（Spanish）, 俄语（Russian）, 法语（French）

讲师

授课教师评分

4.38/5 （20 个评分）

Isabelle Bichindaritz

教学大纲 - 您将从这门课程中学到什么

内容评分90%（1,677 个评分）

周

1

周 1

完成时间为 4 小时

Genes and Data

After this module, you will be able to

完成时间为 4 小时

11 个视频（总计 59 分钟）, 2 个阅读材料, 6 个测验

11 个视频

Introduction to the Course1分钟

Introduction to Module1分钟

DNA and Genes9分钟

RNA and Proteins6分钟

Transcription Process4分钟

Transcription Animation1分钟

Translation Process5分钟

Translation Animation2分钟

Data, Variables, and Big Datasets6分钟

Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis9分钟

Working with cBioPortal - Gene Networks9分钟

2 个阅读材料

Module 1 cBioPortal Data Analytics10分钟

Module 1 Resources10分钟

6 个练习

DNA, RNA, Genes, and Proteins30分钟

Transcription and Translation Processes30分钟

Data, Variables, and Big Datasets30分钟

Working with cBioPortal30分钟

Module 1 Quiz30分钟

Module 1 cBioPortal Data Analytics30分钟

周

2

周 2

完成时间为 8 小时

Preparing Datasets for Analysis

After this module, you will be able to:

完成时间为 8 小时

13 个视频（总计 75 分钟）, 4 个阅读材料, 8 个测验

13 个视频

Introduction to Module4分钟

Datasets and Files10分钟

Data Sources11分钟

Importance of Data Preprocessing4分钟

Data Preprocessing Tasks2分钟

Replacing Missing Values3分钟

Data Normalization9分钟

Data Discretization5分钟

Feature Selection3分钟

Data Sampling2分钟

Principles of R6分钟

R Language1分钟

Jupyter Notebooks 1017分钟

4 个阅读材料

Jupyter Notebooks Essentials10分钟

Notebook Module 2 Tutorial10分钟

Module 2 R Data Preprocessing10分钟

Module 2 Resources10分钟

8 个练习

Datasets and Files30分钟

Data Preprocessing Tasks30分钟

Replacing Missing Values30分钟

Normalization and Discretization30分钟

Data Reduction30分钟

Working with R30分钟

Module 2 Quiz30分钟

Module 2 R Data Preprocessing30分钟

周

3

周 3

完成时间为 7 小时

Finding Differentially Expressed Genes

After this module, you will be able to

完成时间为 7 小时

9 个视频（总计 53 分钟）, 4 个阅读材料, 6 个测验

9 个视频

Introduction to Module2分钟

Overview of Feature Selection Methods13分钟

Filter Methods4分钟

Wrapper Methods4分钟

Evaluation Schemes7分钟

Selecting Differentially Expressed Genes3分钟

Heatmaps6分钟

R Scripts for Feature Selection3分钟

Jupyter Notebooks 1017分钟

4 个阅读材料

Notebook Module 3 Tutorial10分钟

Jupyter Notebooks Essentials10分钟

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10分钟

Module 3 Resources10分钟

6 个练习

Feature Selection Methods30分钟

Evaluation Schemes30分钟

Differentially Expressed Genes30分钟

Heatmaps30分钟

Module 3 Quiz30分钟

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes30分钟

周

4

周 4

完成时间为 8 小时

Predicting Diseases from Genes

After this module, you will be able to

完成时间为 8 小时

12 个视频（总计 85 分钟）, 4 个阅读材料, 10 个测验

12 个视频

Introduction to Module9

Overview of Classification and Prediction Methods8分钟

Classification Methods Based on Analogy12分钟

Classification Methods Based on Rules13分钟

Classification Methods Based on Neural Networks7分钟

Classification Methods Based on Statistics3分钟

Classification Methods Based on Probabilities7分钟

Prediction Methods4分钟

Evaluation Schemes13分钟

Prediction Workflow4分钟

R Scripts for Prediction1分钟

Jupyter Notebooks 1017分钟

4 个阅读材料

Jupyter Notebooks Essentials10分钟

Notebook Module 4 Tutorial10分钟

Module 4 R Predicting Diseases from Genes10分钟

Module 4 Resources10分钟

10 个练习

Overview30分钟

Classification with Analogy30分钟

Classification based on Rules30分钟

Classification with Neural Networks30分钟

Classification based on Statistics30分钟

Classification based on Probabilities30分钟

Prediction Models30分钟

Evaluation Schemes30分钟

Module 4 Quiz30分钟

Module 4 R Predicting Diseases from Genes30分钟

周

5

周 5

完成时间为 7 小时

Determining Gene Alterations

After this module, you will be able to

1. List different types of gene alterations. 2. Compare and contrast methods for detecting gene mutations. 3. Compare and contrast methods for detecting methylation. 4. Compare and contrast methods for detecting copy number variations. 5. Quantify genomic alterations. 6. Connect genomic alterations to differential expression of genes. 7. Write programs in R for determining gene alterations and their relationship with gene expression.

完成时间为 7 小时

9 个视频（总计 81 分钟）, 4 个阅读材料, 8 个测验

9 个视频

Introduction to Module1分钟

Overview of Gene Alterations16分钟

Genetic Mutations9分钟

Finding Genetic Mutations7分钟

Methylation8分钟

Copy Number Alterations10分钟

Genomic Alterations and Gene Expressions16分钟

R Scripts for Gene Alterations1分钟

Jupyter Notebooks 1017分钟

4 个阅读材料

Notebook Module 5 Tutorial10分钟

Jupyter Notebooks Essentials10分钟

Module 5 R Gene Alterations10分钟

Module 5 Resources10分钟

8 个练习

Gene Alterations30分钟

Gene Mutations30分钟

Methylation30分钟

Copy Number Alterations30分钟

Genomic Alterations and Gene Expressions30分钟

Module 5 Quiz (Temporary)30分钟

Module 5 Quiz30分钟

Module 5 R Gene Alterations30分钟

周

6

周 6

完成时间为 6 小时

Clustering and Pathway Analysis

After this module, you will be able to 1. Find clusters in biomedical data involving genes.2. Analyze and visualize biological pathways. 3. Write R scripts for clustering and for pathway analysis.

完成时间为 6 小时

12 个视频（总计 73 分钟）, 5 个阅读材料, 5 个测验

12 个视频

Introduction to Module2分钟

Overview of Clustering Methods7分钟

Similarity Assessment8分钟

Clustering with KMeans7分钟

Density Based Clustering4分钟

Hierarchical Clustering6分钟

Pathway Analysis12分钟

Pathway Discovery7分钟

Pathway Visualization6分钟

R Scripts for Clustering and Pathway Analysis1分钟

Jupyter Notebooks 1017分钟

Concluding Remarks1分钟

5 个阅读材料

Jupyter Notebooks Essentials10分钟

Notebook Module 6 Tutorial10分钟

Module 6 R Clustering and Pathways10分钟

Module 6 Resources10分钟

Acknowledgements10分钟

5 个练习

Clustering30分钟

Clustering Methods30分钟

Pathways30分钟

Module 6 Quiz30分钟

Module 6 R Clustering and Pathways30分钟

常见问题

我什么时候能够访问课程视频和作业？
讲座和作业的访问权限取决于您的注册类型。如果您以旁听模式参加课程，则可以免费查看大多数课程资料。要访问评分作业并获得证书，您需要在旁听期间或之后购买证书体验。如果看不到旁听选项：
课程可能不提供旁听选项。您可以尝试免费试用，也可以申请助学金。
课程可能会改为提供'完整课程，没有证书'。通过此选项，您可以查看所有课程材料、提交所要求的作业，以及获得最终成绩。这也意味着您将无法购买证书体验。
我购买证书后会得到什么？
您购买证书后，将有权访问所有课程材料，包括评分作业。完成课程后，您的电子课程证书将添加到您的成就页中，您可以通过该页打印您的课程证书或将其添加到您的领英档案中。如果您只想阅读和查看课程内容，可以免费旁听课程。
Is financial aid available?
是的，Coursera 可以向无法承担学费的学生提供助学金。点击左侧‘注册’按钮下的‘助学金’链接即可申请助学金。您可以根据屏幕提示完成申请，申请获批后会收到通知。了解详情。

还有其他问题吗？请访问学生帮助中心。

Big Data, Genes, and Medicine